Ο Ντούνης ξεκίνησε την καριέρα του από τις ακαδημίες του Πανιώνιου το καλοκαίρι του 2011. Με την ομάδα της Νέας Σμύρνης αγωνίστηκε σε 53 αγώνες, πετυχαίνοντας επτά γκολ.
Την περίοδο 2014-15 αποκτήθηκε ως ελεύθερος από την ΑΕΚ, με την οποία πέτυχε πέντε τέρματα σε δεκαπέντε εμφανίσεις, βοηθώντας τον αθηναϊκό σύλλογο να ανέβει στην πρώτη κατηγορία του πρωταθλήματος.
Τον Σεπτέμβριο του 2015, υπέγραψε συμβόλαιο συνεργασίας με την ομάδα του Άρη. Στην πρώτη του χρονιά πραγματοποίησε 27 συμμετοχές πρωταθλήματος και σημείωσε 12 τέρματα, ενώ τη δεύτερη 23 συμμετοχές και 6 τέρματα.